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B、实验的自变量是垂体与下丘脑之间是否存在血液联系，不存在联系时垂体仍正常，但生殖器官萎缩，说明动物生殖器官的发育受下丘脑分泌的物质影响，不能说明受垂体直接控制，B错误；
C、根据题目分析，恢复垂体与下丘脑之间正常的血液联系，生殖器官的功能恢复正常，说明下丘脑可能分泌了某种化学物质通过血液运输至垂体，C正确；
D、实验中人为去除某种影响因素，属于减法原理，该实验是与正常相比阻断也就减去了下丘脑对垂体的血液连接，依据了实验变量控制中的“减法原理”，D正确。
故选B。
13．B
【分析】染色质是由DNA和蛋白质（组蛋白）组成的。
【详解】A、转录需要解旋，组蛋白乙酰化可破坏染色质中组蛋白和DNA之间的紧密结合，所以，组蛋白乙酰化程度与基因转录活性呈正相关，A错误；
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